Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PYDC1Q8WXC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PYDC1Q8WXC3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PYDC1Q8WXC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms