Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3RF2Q8TEC5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3RF2Q8TEC5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF2Q8TEC5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms