Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC44.2■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC44.19■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC44.16■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
RB1CC1Q8TDY2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
RB1CC1Q8TDY2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
RB1CC1Q8TDY2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms