Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC110Q8TBZ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC110Q8TBZ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC110Q8TBZ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC110Q8TBZ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC110Q8TBZ0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC110Q8TBZ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC110Q8TBZ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC110Q8TBZ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms