Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF397Q8NF99 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF397Q8NF99 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF397Q8NF99 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms