Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSNK2A3Q8NEV1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSNK2A3Q8NEV1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSNK2A3Q8NEV1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CSNK2A3Q8NEV1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK2A3Q8NEV1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms