Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC191Q8NCU4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC191Q8NCU4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms