Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDPRQ8NCN5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDPRQ8NCN5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms