Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP11CQ8NB49 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11CQ8NB49 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11CQ8NB49 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms