Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC63Q8NA47 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms