Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD53Q8N9V6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD53Q8N9V6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANKRD53Q8N9V6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms