Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBR7Q8N806 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBR7Q8N806 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms