Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF148Q8N7C7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF148Q8N7C7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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