Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T3

ARFGAP1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP1Q8N6T3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFGAP1Q8N6T3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARFGAP1Q8N6T3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARFGAP1Q8N6T3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms