Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCML4Q8N228 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCML4Q8N228 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms