Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC65Q8IXS2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC65Q8IXS2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms