Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM42Q8IWZ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms