Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC8AQ8IWT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC8AQ8IWT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC8AQ8IWT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC8AQ8IWT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8AQ8IWT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms