Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3BQ8IVW6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3BQ8IVW6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3BQ8IVW6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3BQ8IVW6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3BQ8IVW6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3BQ8IVW6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3BQ8IVW6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID3BQ8IVW6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3BQ8IVW6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms