Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGDCC3Q8IVU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGDCC3Q8IVU1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms