Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A9Q8IVM8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms