Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PASD1Q8IV76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PASD1Q8IV76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms