Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS6Q8IU80 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS6Q8IU80 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS6Q8IU80 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms