Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TREML1Q86YW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREML1Q86YW5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms