Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSIG1Q86XK7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG1Q86XK7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms