Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPBP1Q86WP2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPBP1Q86WP2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPBP1Q86WP2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms