Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRADAQ7RTN6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRADAQ7RTN6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms