Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms