Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2AQ7L0J3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SV2AQ7L0J3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms