Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27LQ71UM5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS27LQ71UM5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms