Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMUB2Q71RG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms