Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms