Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
BEND4Q6ZU67 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEND4Q6ZU67 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms