Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.9 ms