Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP6Q6ZN66 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP6Q6ZN66 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms