Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP10Q6VN20 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms