Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCBE1Q6UXH8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms