Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW63

KDELC1, KDEL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELC1Q6UW63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELC1Q6UW63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELC1Q6UW63 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELC1Q6UW63 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms