Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC171Q6TFL3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC171Q6TFL3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms