Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF7Q6Q0C0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF7Q6Q0C0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms