Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TXNDC11Q6PKC3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNDC11Q6PKC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms