Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms