Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNNM4Q6P4Q7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNNM4Q6P4Q7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNNM4Q6P4Q7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms