Protein–RNA interactions for Protein: Q6P0N0

MIS18BP1, Mis18-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18BP1Q6P0N0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18BP1Q6P0N0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18BP1Q6P0N0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18BP1Q6P0N0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18BP1Q6P0N0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18BP1Q6P0N0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18BP1Q6P0N0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18BP1Q6P0N0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIS18BP1Q6P0N0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIS18BP1Q6P0N0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms