Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPP4R4Q6NUP7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPP4R4Q6NUP7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms