Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRHL2Q6ISB3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRHL2Q6ISB3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms