Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRNP48Q6IEG0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRNP48Q6IEG0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRNP48Q6IEG0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP48Q6IEG0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP48Q6IEG0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP48Q6IEG0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP48Q6IEG0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP48Q6IEG0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP48Q6IEG0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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