Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
REP15Q6BDI9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REP15Q6BDI9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms