Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD40Q6AI12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms