Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3L3Q68CJ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms